24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3017 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3017  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  357  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  37.58 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  34.82 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0823  protein of unknown function DUF955  37.84 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  31.54 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  31.54 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  30.88 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  28.77 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  31.51 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.51 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.51 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0019  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  30.82 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  33.63 
 
 
136 aa  58.2  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  27.04 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  27.12 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0297  hypothetical protein  32.65 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.301247  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0485  hypothetical protein  32.99 
 
 
86 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  34.26 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5810  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0593  hypothetical protein  39.39 
 
 
136 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.81 
 
 
175 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  27.04 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>