41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1388 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
153 aa  313  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0823  protein of unknown function DUF955  42.47 
 
 
147 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  44.63 
 
 
146 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  46.15 
 
 
136 aa  92  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  42.74 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  43.4 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  40.83 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  42.86 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  42.86 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2970  hypothetical protein  37.39 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284014  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5810  hypothetical protein  36.44 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  41.07 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3017  hypothetical protein  34.82 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3927  protein of unknown function DUF955  32.88 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0019  hypothetical protein  32.17 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0297  hypothetical protein  38.74 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.301247  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  36.11 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0485  hypothetical protein  38.36 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192781  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  36.61 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  32.98 
 
 
362 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  25.47 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  32.2 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0696  protein of unknown function DUF955  24.59 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  28.69 
 
 
257 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  26.88 
 
 
404 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1145  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000142865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.89 
 
 
390 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  28.89 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2435  prophage LambdaBa01, repressor protein, putative  27.59 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000773608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  35.04 
 
 
272 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  31.58 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.3 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  27.59 
 
 
352 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  30.61 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  24.18 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 
147 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>