61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  36.79 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  35.59 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  33.83 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4400  hypothetical protein  25.31 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4489  hypothetical protein  26.21 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.55 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  33.04 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  31.62 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  38.64 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.5 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  35.79 
 
 		 362 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0699  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000228437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  35.05 
 
 		 435 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  35.05 
 
 		 435 aa  49.3  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  33.93 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  29.03 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.95 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  28.5 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  35.37 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  31.21 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  30.63 
 
 		 181 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  22.01 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  40 
 
 		 160 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  39.68 
 
 		 182 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  37.04 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  34.52 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  26.4 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.75 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  30.4 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  29.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 1177 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  31.65 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  30.08 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  30.17 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  27.64 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  26.49 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  32.03 
 
 		 188 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  39.06 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  39.74 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  31.58 
 
 		 419 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  29.06 
 
 		 168 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  26.21 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  26.61 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  27.64 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  27.64 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1993  hypothetical protein  30.65 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  23.9 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  35.82 
 
 		 173 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 1180 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>