27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3077 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  54.55 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  34.41 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  29.45 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  38.98 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.72 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  33.01 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  29.52 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  44.44 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  40.74 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  45.28 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  32.38 
 
 		 360 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  24.66 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  40.3 
 
 		 394 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.66 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  33.04 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  32.5 
 
 		 351 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  35.44 
 
 		 285 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  32.99 
 
 		 399 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  38.24 
 
 		 416 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  29.46 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  29.46 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  29.46 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  44.64 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>