32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0986 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4663  putative neutral zinc metallopeptidase  34.38 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  35.09 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4678  protein of unknown function DUF955  36.36 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  38.71 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  35.19 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  36.27 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0183  hypothetical protein  31.29 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.93 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  36.63 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  36.14 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  36.14 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  36.84 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  30.3 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  30.63 
 
 
302 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  40.68 
 
 
425 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  41.38 
 
 
404 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  35.16 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  31.19 
 
 
394 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  30.2 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  38.36 
 
 
435 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  38.36 
 
 
435 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  36.9 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  33.71 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  33.71 
 
 
171 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  39.62 
 
 
360 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  40.35 
 
 
174 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  42.86 
 
 
416 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>