39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0651 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  33.77 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  33.12 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  33.12 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  26.96 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  35.92 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  31.54 
 
 
286 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  34.31 
 
 
395 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  33.93 
 
 
372 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  36.19 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  36.45 
 
 
269 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  28.49 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  29.7 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  27.87 
 
 
341 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1262  hypothetical protein  41.67 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.228551  normal  0.373581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  38.96 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34.91 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  29.89 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
165 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  30.1 
 
 
391 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  30.1 
 
 
391 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  31.4 
 
 
129 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  30.69 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  30.23 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  27.2 
 
 
383 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 
357 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.7 
 
 
372 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  34.58 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  30.39 
 
 
307 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.88 
 
 
370 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
173 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  31.71 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  31.48 
 
 
295 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  27.34 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  27.34 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  27.95 
 
 
285 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  26.36 
 
 
262 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>