94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3235 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  39.71 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  32.56 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  32.42 
 
 		 302 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  33.96 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  33.2 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  28.51 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  28.51 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  28.51 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  29.58 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  35.62 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  30.22 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  32.91 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  34.26 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  33.85 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  29.32 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  31.84 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  26.36 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  27.48 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  34.26 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.86 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  35.94 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.96 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.08 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  28.03 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  36.17 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  36.17 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  27.23 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  37.61 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  35.54 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B25  hypothetical protein  29.7 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.548873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  40.48 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  31.18 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  33.94 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  31.54 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  31.2 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  38.61 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  38.61 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  34.65 
 
 		 174 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  28.68 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  40.59 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  34.62 
 
 		 366 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  27.64 
 
 		 352 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  23.27 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  37.08 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  33.7 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  38.89 
 
 		 350 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  37.5 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  32.58 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  33 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  36 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  35.35 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.45 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  32.74 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  40.62 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  28.04 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  28.04 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  37.36 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  30.43 
 
 		 370 aa  46.2  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  36.26 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  23.42 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  27.34 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  34.23 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  43.08 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  32.65 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  31.58 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  26.89 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  27.64 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  29.2 
 
 		 347 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  38.89 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  35.29 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  32.61 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  26.67 
 
 		 365 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  35.58 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1853  hypothetical protein  27.66 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.163672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 360 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  29.81 
 
 		 355 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0395  hypothetical protein  31.52 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  34.57 
 
 		 345 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  29.63 
 
 		 425 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>