25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1728 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 331 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  30.15 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5400  hypothetical protein  30.09 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3743  hypothetical protein  27.06 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127692  normal  0.33847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  28.04 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2251  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116147  normal  0.0186362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0037  protein of unknown function DUF955  27.88 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.97 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.37 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  33.03 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  35.04 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  35.04 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  36.71 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  31.82 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  37.04 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  32.77 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.23 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.08 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  34.17 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  36.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.33 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  29.45 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 422 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.56 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>