15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1009 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5400  hypothetical protein  34.91 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2251  hypothetical protein  31.89 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116147  normal  0.0186362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0956  hypothetical protein  29.75 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215929  normal  0.12652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  28.04 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3743  hypothetical protein  26.62 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127692  normal  0.33847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0037  protein of unknown function DUF955  27.8 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.66 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.04 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  27.8 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  26.28 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  39.66 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.41 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  48.15 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>