35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4709 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  84.44 
 
 		 360 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 360 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.48 
 
 		 385 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  37.64 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.42 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  31.98 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.67 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  29.44 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  31.04 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.85 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.09 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.78 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  27.35 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.18 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.29 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.86 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.07 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.15 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.05 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.92 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.58 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  24.86 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.78 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  23.67 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  24.81 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  38.64 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.51 
 
 		 124 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  32.26 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.51 
 
 		 175 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1009  hypothetical protein  27.41 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>