129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1808 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
358 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
376 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.7 
 
 
361 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.28 
 
 
369 aa  175  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 
371 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.76 
 
 
373 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.35 
 
 
383 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  31.96 
 
 
371 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.81 
 
 
368 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  30.08 
 
 
386 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.36 
 
 
350 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.11 
 
 
385 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  31.38 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  27.35 
 
 
360 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.22 
 
 
368 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.59 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.15 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  29.57 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  72 
 
 
76 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.22 
 
 
334 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.64 
 
 
228 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.32 
 
 
362 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  29.45 
 
 
409 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.57 
 
 
292 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  25.98 
 
 
422 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.81 
 
 
116 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
117 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.68 
 
 
100 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.3 
 
 
106 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.67 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  47.3 
 
 
96 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  22.66 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  21.05 
 
 
408 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.24 
 
 
106 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.68 
 
 
101 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.47 
 
 
105 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 
101 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.26 
 
 
95 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.33 
 
 
101 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.16 
 
 
110 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.71 
 
 
108 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.12 
 
 
118 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.37 
 
 
103 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.44 
 
 
98 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
104 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.38 
 
 
99 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.38 
 
 
99 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.84 
 
 
100 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
115 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  44.93 
 
 
107 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  38.82 
 
 
111 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  35.56 
 
 
104 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.81 
 
 
92 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 
103 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.24 
 
 
100 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.47 
 
 
101 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
102 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.55 
 
 
101 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
99 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
97 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 
102 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
101 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
151 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 
95 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.68 
 
 
102 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  35.24 
 
 
103 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  35.58 
 
 
101 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  30.77 
 
 
119 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  40.79 
 
 
102 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.79 
 
 
101 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 
106 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.29 
 
 
101 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 
95 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 
99 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 
99 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 
101 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.57 
 
 
99 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.29 
 
 
103 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  40.3 
 
 
96 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
104 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 
108 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
93 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.27 
 
 
102 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  33.72 
 
 
199 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
104 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.47 
 
 
99 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 
96 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 
100 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.33 
 
 
99 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6218  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.68 
 
 
80 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119122  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 
107 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 
106 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  38.16 
 
 
108 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.89 
 
 
98 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>