108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2261 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
76 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  72 
 
 
358 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.93 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.52 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.79 
 
 
369 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.28 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.62 
 
 
368 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
361 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.19 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  45.45 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.58 
 
 
228 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  43.94 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.19 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.91 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.08 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.24 
 
 
371 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  52.38 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.44 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
110 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.78 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 
380 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  40 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  38.67 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.08 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.58 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.54 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 
371 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.42 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  38.24 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  38.24 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
101 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  35.82 
 
 
151 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 
104 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 
101 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.24 
 
 
101 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 
151 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  35.38 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.38 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  39.39 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.62 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.79 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.79 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2942  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.19 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00934275  hitchhiker  0.000711707 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
362 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.82 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.62 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  38.78 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.38 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.51 
 
 
383 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  36.76 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  38.03 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.78 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.82 
 
 
98 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.78 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6218  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.73 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119122  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  31.25 
 
 
386 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  41.3 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.85 
 
 
96 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0634  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 
102 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.29 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  40.43 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.86 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  38.78 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.78 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.78 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.14 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.3 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1385  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2419  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.98 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.43 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.89 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.82 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.23 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  28.12 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.81 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  28.12 
 
 
131 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.12 
 
 
131 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>