78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3421 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 383 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.13 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.35 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.37 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  27.61 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.72 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.51 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  28.73 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.78 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.57 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.43 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  26.35 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.14 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  23.48 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.15 
 
 		 334 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.14 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.14 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  28.38 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  24.43 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.45 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.39 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  23.62 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.64 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  22.46 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  24.55 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 100 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 		 95 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  22.42 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 100 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 102 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 106 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 117 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 101 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 101 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.14 
 
 		 110 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 95 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  32.39 
 
 		 119 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1906  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.99 
 
 		 100 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  30.69 
 
 		 113 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.69 
 
 		 113 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  30.69 
 
 		 131 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 95 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  30.69 
 
 		 131 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.14 
 
 		 101 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  30.69 
 
 		 131 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.39 
 
 		 94 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 		 98 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 		 108 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.76 
 
 		 100 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.69 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  30.69 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.39 
 
 		 101 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  30.69 
 
 		 131 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.23 
 
 		 101 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.68 
 
 		 106 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.46 
 
 		 113 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.35 
 
 		 101 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.17 
 
 		 99 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.51 
 
 		 76 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.73 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2942  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.68 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00934275  hitchhiker  0.000711707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2554  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 96 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276945  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 116 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 151 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 123 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  35.29 
 
 		 96 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  33.33 
 
 		 101 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  31.94 
 
 		 99 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3561  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 96 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  33.33 
 
 		 101 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 104 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>