124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2492 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 368 aa  767    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  70.8 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.1 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.36 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.23 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.7 
 
 		 371 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  35.88 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  34.17 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  33.43 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.46 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  28.61 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.97 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.59 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.89 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  28.33 
 
 		 368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.45 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  27.89 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.47 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.88 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.25 
 
 		 228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.12 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.57 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  34.48 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.59 
 
 		 116 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.07 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  22.49 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  23.74 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.22 
 
 		 100 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  26.35 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.72 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.22 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.8 
 
 		 120 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  37.8 
 
 		 120 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  37.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 101 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 		 98 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  36.47 
 
 		 96 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  36.14 
 
 		 119 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 		 101 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 		 97 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.86 
 
 		 102 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  28.97 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.68 
 
 		 105 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 105 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  36.67 
 
 		 105 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 		 108 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.37 
 
 		 100 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 101 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 98 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.49 
 
 		 95 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 95 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 101 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  30.86 
 
 		 95 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.49 
 
 		 117 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.17 
 
 		 132 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  29.89 
 
 		 104 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 104 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 100 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 95 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.23 
 
 		 106 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.86 
 
 		 104 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 		 100 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 		 151 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 		 98 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  20.81 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.37 
 
 		 103 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  39.73 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.91 
 
 		 99 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.5 
 
 		 109 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 106 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.94 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  31.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 98 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.12 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.12 
 
 		 104 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.43 
 
 		 101 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.48 
 
 		 101 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.23 
 
 		 97 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.13 
 
 		 108 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.76 
 
 		 99 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.91 
 
 		 106 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.25 
 
 		 94 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.58 
 
 		 100 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.58 
 
 		 100 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 98 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 102 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>