254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0902 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  70.3 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  64.52 
 
 		 93 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  65.59 
 
 		 93 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  66.67 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  61.29 
 
 		 93 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3226  plasmid maintenance system killer  63.44 
 
 		 95 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  61.29 
 
 		 93 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  69.62 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.79 
 
 		 100 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4369  plasmid maintenance system killer  60.22 
 
 		 94 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0624655  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.52 
 
 		 102 aa  118  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  60.22 
 
 		 99 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2020  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 		 93 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  55.32 
 
 		 94 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  60.22 
 
 		 92 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  58.06 
 
 		 93 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  56.99 
 
 		 93 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 93 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5479  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.64 
 
 		 99 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  54.84 
 
 		 93 aa  111  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1125  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.68 
 
 		 119 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 		 92 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.09 
 
 		 123 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  56.67 
 
 		 101 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4191  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 92 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  57.45 
 
 		 92 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  60.64 
 
 		 93 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1386  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 92 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  52.69 
 
 		 93 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  51.06 
 
 		 94 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  52.69 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  52.69 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  56.99 
 
 		 92 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.5 
 
 		 99 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.5 
 
 		 99 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 93 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  56.99 
 
 		 92 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 		 92 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 		 93 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 92 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0416  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 		 92 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  48 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2030  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 97 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  54.26 
 
 		 95 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0213  proteic killer protein, putative  52.69 
 
 		 92 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  52.69 
 
 		 92 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2019  plasmid maintenance system antidote protein  49.49 
 
 		 99 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  56.38 
 
 		 93 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3615  plasmid maintenance system killer  62.77 
 
 		 94 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.443505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2763  virulence-associated protein, putative  47.42 
 
 		 100 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1424  plasmid maintenance system killer  51.09 
 
 		 93 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 		 92 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  45.16 
 
 		 112 aa  96.3  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  53.76 
 
 		 93 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4132  plasmid maintenance system killer  56.63 
 
 		 86 aa  95.5  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0858239  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.53 
 
 		 104 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  51.61 
 
 		 92 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.47 
 
 		 101 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  44.09 
 
 		 105 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  45 
 
 		 99 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  49.46 
 
 		 105 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 95 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.56 
 
 		 95 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.45 
 
 		 99 aa  92  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 		 93 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.9 
 
 		 100 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45 
 
 		 99 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.48 
 
 		 106 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 95 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.92 
 
 		 106 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 93 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  45.16 
 
 		 96 aa  89.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 		 92 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 		 93 aa  88.2  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  46.51 
 
 		 99 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  46.24 
 
 		 93 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.94 
 
 		 99 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.81 
 
 		 101 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  48.31 
 
 		 96 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 103 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.65 
 
 		 99 aa  85.1  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.16 
 
 		 98 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  45.45 
 
 		 103 aa  84.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 		 93 aa  84.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  45.45 
 
 		 101 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  41.49 
 
 		 94 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.94 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4028  plasmid maintenance system killer  48.42 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.07 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.35 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.76 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.7 
 
 		 93 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 100 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  36.67 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  36.67 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>