198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0372 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  60.64 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  59.38 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  58.51 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  61.7 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0827  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  90 
 
 		 62 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510013  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.74 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  50.62 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.22 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  47.67 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  42.39 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.53 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.68 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.57 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.25 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.15 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.21 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.25 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.25 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40.7 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.86 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.2 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.78 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.82 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  40.74 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.1 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  41.98 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.48 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.7 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  33.7 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  33.7 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  33.7 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.29 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.68 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.18 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  40.43 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.37 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.23 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.46 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.31 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.93 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.13 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0929  putative antidote protein  41.1 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  37.84 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  35.62 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  47.54 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.91 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.29 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  38.55 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  36.47 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.58 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  32.94 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4764  plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.559463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  37.66 
 
 		 1365 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  38.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  38.36 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.95 
 
 		 1370 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  38.36 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  38.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  40 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00611  Plasmid maintenance system antidote protein  64.29 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.62348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>