137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2644 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  100 
 
 		 1365 aa  2780    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.76 
 
 		 1370 aa  1338    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1253 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 1242 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 1352 aa  407  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 1269 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1251 aa  370  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 1350 aa  352  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1271 aa  342  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1260 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  26.24 
 
 		 1346 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1180 aa  291  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  26.7 
 
 		 862 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  28.14 
 
 		 720 aa  228  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1133 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  28.52 
 
 		 753 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  27 
 
 		 532 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  25.78 
 
 		 474 aa  126  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.19 
 
 		 107 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.33 
 
 		 109 aa  75.5  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 108 aa  75.1  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 99 aa  74.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 107 aa  74.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  41.25 
 
 		 110 aa  73.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.89 
 
 		 96 aa  68.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.89 
 
 		 104 aa  68.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  68.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 103 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 99 aa  68.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 94 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.3 
 
 		 109 aa  67.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.76 
 
 		 93 aa  66.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 108 aa  64.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  39.02 
 
 		 99 aa  64.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 95 aa  64.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 		 98 aa  62.4  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.22 
 
 		 105 aa  62.4  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.51 
 
 		 99 aa  62.4  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  39.44 
 
 		 99 aa  62  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 102 aa  62  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  43.06 
 
 		 167 aa  62  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 101 aa  61.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.25 
 
 		 93 aa  60.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 100 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.05 
 
 		 100 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.05 
 
 		 100 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.66 
 
 		 96 aa  60.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.44 
 
 		 98 aa  60.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.05 
 
 		 100 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.89 
 
 		 151 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  41.33 
 
 		 90 aa  59.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 95 aa  59.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.93 
 
 		 101 aa  58.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  34.74 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.11 
 
 		 95 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.95 
 
 		 100 aa  57.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.48 
 
 		 91 aa  57  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.48 
 
 		 91 aa  57  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  43.1 
 
 		 96 aa  56.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.44 
 
 		 102 aa  56.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.52 
 
 		 106 aa  56.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 		 104 aa  55.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.05 
 
 		 102 aa  55.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.89 
 
 		 98 aa  55.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 101 aa  55.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.34 
 
 		 72 aa  55.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 95 aa  55.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  40.85 
 
 		 97 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.07 
 
 		 91 aa  54.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 104 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.56 
 
 		 94 aa  53.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 116 aa  53.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.21 
 
 		 105 aa  53.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  53.57 
 
 		 78 aa  53.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  36.62 
 
 		 95 aa  53.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 100 aa  52.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.42 
 
 		 109 aa  52.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.29 
 
 		 98 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  35.62 
 
 		 104 aa  52.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  52  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 99 aa  51.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.96 
 
 		 91 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 104 aa  51.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.26 
 
 		 103 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 100 aa  50.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 108 aa  50.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.21 
 
 		 99 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.95 
 
 		 98 aa  50.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  29.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0885  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.91 
 
 		 102 aa  50.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27690  plasmid maintenance system antidote protein  35.23 
 
 		 99 aa  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 106 aa  50.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  34.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 105 aa  50.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 		 100 aa  49.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 107 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.11 
 
 		 99 aa  48.9  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  38.03 
 
 		 95 aa  48.9  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>