18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3816 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  100 
 
 		 753 aa  1535    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1251 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 1352 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 1350 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  31.3 
 
 		 532 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  27.54 
 
 		 1346 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  26.03 
 
 		 862 aa  212  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  28.02 
 
 		 1365 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1260 aa  203  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1180 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 1269 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1271 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 1242 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1253 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  23.08 
 
 		 1370 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  40.61 
 
 		 720 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1133 aa  106  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2099  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1286 aa  44.3  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00619148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>