23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3900 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  57.44 
 
 		 862 aa  1038    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  73.89 
 
 		 1271 aa  1340    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  100 
 
 		 1180 aa  2438    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1133 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 1352 aa  343  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 1242 aa  330  9e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1260 aa  320  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  26.88 
 
 		 1346 aa  289  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 1269 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1253 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 1350 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.63 
 
 		 1365 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1251 aa  280  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.11 
 
 		 1370 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  25.68 
 
 		 753 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  32.15 
 
 		 720 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  26.97 
 
 		 532 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0123  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1793 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3689  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1702 aa  61.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.558287 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  25 
 
 		 1809 aa  51.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4648  hypothetical protein  24 
 
 		 1711 aa  49.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5269  hypothetical protein  25 
 
 		 1796 aa  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1765 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>