13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4648 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3689  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1702 aa  1144    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.558287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4648  hypothetical protein  100 
 
 		 1711 aa  3443    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0123  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1793 aa  258  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5269  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1796 aa  225  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0639  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1622 aa  224  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1809 aa  217  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1765 aa  71.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2308  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1535 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000339602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2242  AAA ATPase  23.42 
 
 		 1668 aa  60.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  24 
 
 		 1180 aa  49.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0835  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1573 aa  48.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.18 
 
 		 942 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1996  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1482 aa  47  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.141333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>