11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0123 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0639  hypothetical protein  67.41 
 
 		 1622 aa  2241    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1809 aa  1096    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5269  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1796 aa  1131    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00229781  unclonable  0.0000748398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0123  hypothetical protein  100 
 
 		 1793 aa  3672    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4648  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1711 aa  244  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3689  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1702 aa  226  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.558287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2242  AAA ATPase  25.37 
 
 		 1668 aa  99.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0933  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1765 aa  77.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.686866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2308  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1535 aa  74.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000339602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1180 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3041  AAA ATPase  20.32 
 
 		 1706 aa  57.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>