18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2546 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 1260 aa  2558    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 1269 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 1352 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 1242 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 1350 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1271 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  27.39 
 
 		 1346 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1253 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.49 
 
 		 1370 aa  373  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.65 
 
 		 1365 aa  337  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1180 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1251 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  27.8 
 
 		 862 aa  301  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1133 aa  243  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  25.78 
 
 		 753 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  28.07 
 
 		 720 aa  181  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  25.95 
 
 		 532 aa  143  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  26.79 
 
 		 474 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>