14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3817 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  965    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1251 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  40.44 
 
 		 720 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 1352 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  29.78 
 
 		 1346 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 1350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 1242 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.68 
 
 		 1370 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  25.78 
 
 		 1365 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1260 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 1269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1253 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  19.08 
 
 		 1133 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>