18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3854 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  54.74 
 
 		 720 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 1251 aa  2533    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 1350 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 1352 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  36.55 
 
 		 753 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  31.35 
 
 		 1346 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 1242 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1271 aa  396  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  39.33 
 
 		 532 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  27.85 
 
 		 1365 aa  364  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  42.08 
 
 		 474 aa  350  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.01 
 
 		 1370 aa  348  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 1269 aa  338  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1253 aa  322  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1260 aa  313  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1180 aa  280  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  28.02 
 
 		 862 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1133 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>