43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6201 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 1350 aa  2722    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  61.25 
 
 		 1346 aa  1666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  40.03 
 
 		 1352 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1251 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 1242 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 1269 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1253 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1260 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.89 
 
 		 1370 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1271 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.42 
 
 		 1365 aa  345  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  33.15 
 
 		 720 aa  341  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1180 aa  286  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  26.91 
 
 		 862 aa  268  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  28.84 
 
 		 753 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1133 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  29.32 
 
 		 474 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  29.42 
 
 		 532 aa  148  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  59.38 
 
 		 490 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 75 aa  63.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 106 aa  59.7  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 86 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 105 aa  60.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 69 aa  58.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 85 aa  55.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.62 
 
 		 82 aa  50.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  49.7  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 78 aa  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 108 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 82 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  42.19 
 
 		 100 aa  48.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 115 aa  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  41.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  38.81 
 
 		 100 aa  47.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 95 aa  46.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 65 aa  45.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  43.33 
 
 		 94 aa  45.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  45.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 92 aa  45.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  45.16 
 
 		 84 aa  45.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 78 aa  45.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 78 aa  45.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>