18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4051 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1260 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 1269 aa  2523    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  31.24 
 
 		 1352 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 1242 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 1350 aa  426  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  29.1 
 
 		 1346 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  27.21 
 
 		 1365 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.9 
 
 		 1370 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1253 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1251 aa  341  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1271 aa  338  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1180 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  26.76 
 
 		 862 aa  277  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1133 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  29.02 
 
 		 720 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  25.81 
 
 		 753 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  29.4 
 
 		 532 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  26.5 
 
 		 474 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>