18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0279 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  54.37 
 
 
862 aa  954    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  100 
 
 
1271 aa  2602    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  73.27 
 
 
1180 aa  1352    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  29.49 
 
 
1133 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 
1352 aa  476  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 
1242 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  28.94 
 
 
1251 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  27.38 
 
 
1346 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  28.88 
 
 
1260 aa  390  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  27.97 
 
 
1253 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 
1350 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  26.36 
 
 
1365 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 
1269 aa  335  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.43 
 
 
1370 aa  331  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  30.52 
 
 
720 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  25.84 
 
 
753 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  27.33 
 
 
532 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  26.12 
 
 
474 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>