45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3311 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  40.03 
 
 		 1350 aa  958    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  38.44 
 
 		 1346 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 1352 aa  2712    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1422  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 1242 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3854  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1251 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4051  XRE family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 1269 aa  489  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544499  normal  0.21664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0279  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1271 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0426649  unclonable  0.0000349797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2546  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1260 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00453423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0681  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1253 aa  445  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00452665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  27.32 
 
 		 1365 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.43 
 
 		 1370 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3900  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1180 aa  350  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.380579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2346  hypothetical protein  29.04 
 
 		 862 aa  333  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3816  hypothetical protein  31.21 
 
 		 753 aa  322  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1851  hypothetical protein  32.51 
 
 		 720 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.445905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0982  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1133 aa  267  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.276758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3817  hypothetical protein  32.22 
 
 		 474 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1850  hypothetical protein  28.27 
 
 		 532 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158477  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  57.35 
 
 		 490 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  50.65 
 
 		 105 aa  72.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  41.84 
 
 		 106 aa  68.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 75 aa  68.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  38.75 
 
 		 90 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 86 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  58.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  48.65 
 
 		 99 aa  57.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 217 aa  56.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 85 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  44.26 
 
 		 100 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  46.67 
 
 		 88 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 69 aa  52.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 108 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 82 aa  49.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  42.19 
 
 		 94 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 78 aa  48.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  43.08 
 
 		 82 aa  48.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  34.07 
 
 		 100 aa  48.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  43.55 
 
 		 87 aa  48.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 82 aa  47.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  46.88 
 
 		 361 aa  46.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  36.62 
 
 		 108 aa  47  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  36.51 
 
 		 92 aa  45.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5399  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 		 74 aa  45.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  45.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>