68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1704 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  56.57 
 
 
99 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  41.75 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24850  hypothetical protein  43.56 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2275  hypothetical protein  39.6 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10350  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.434513  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  43.42 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  47.06 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  43.24 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
108 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  42.11 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  46.67 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
490 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  42.11 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  42.5 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  46.25 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
1350 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  37.8 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
117 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
103 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  37.84 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  39.13 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  42.86 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  40.58 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  36.99 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  36.71 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  39.47 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  35.71 
 
 
341 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  45.21 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 
82 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
359 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  40 
 
 
204 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  39.73 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  44.26 
 
 
75 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>