53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0256 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  158  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  41.25 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  40.79 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  44.74 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  44.3 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
85 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
90 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 
84 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  37.66 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  41.25 
 
 
1346 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  46.05 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  39.51 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  46.25 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  36.71 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  40.79 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  41.79 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  40.26 
 
 
83 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  42.17 
 
 
83 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>