59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0165 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  183  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  67.02 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  77.5 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  73.75 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  75.31 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  72.15 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  70.89 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  70.89 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  66.25 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  67.57 
 
 		 83 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 77 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  59.77 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  45.98 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  46.25 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  48.15 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  44.3 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  43.75 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  45.57 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  44.3 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  42.5 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  43.37 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  40.24 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 359 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  39.24 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  40.79 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  38.55 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  37.97 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  41.77 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  41.89 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>