20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1818 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.12 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  41.27 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  39.68 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  39.71 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>