55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0399 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 92 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  51.39 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  46.48 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  42.31 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  45.57 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  40 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  44.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  44.74 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  41.43 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  41.03 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 490 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 1350 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 359 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  36 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 267 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  39.73 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>