23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6245 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  157  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  57.33 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  41.89 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  40.54 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  39.19 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  39.13 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  36.71 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  40.28 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  37.68 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 75 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>