44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0293 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  91.67 
 
 		 99 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  50.62 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  43.24 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  41.89 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  39.13 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  40 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  35.9 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 		 361 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  35.29 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  42.47 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  39.19 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 1350 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  35.53 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 1352 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5399  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 74 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  39.24 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  37.68 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  39.34 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  32.43 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  36.36 
 
 		 1346 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>