77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3182 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  58.67 
 
 		 105 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  56 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  52.7 
 
 		 85 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  55.41 
 
 		 88 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  42.5 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  46.91 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  47.22 
 
 		 99 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 75 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  48.68 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  47.37 
 
 		 82 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 82 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  41.03 
 
 		 99 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  48.05 
 
 		 88 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  44.74 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  47.3 
 
 		 82 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  44.16 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 78 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  43.84 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  46.58 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 86 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 108 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 77 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 85 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  43.24 
 
 		 85 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 490 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  45.07 
 
 		 94 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 83 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  43.42 
 
 		 82 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5078  hypothetical protein  37.33 
 
 		 105 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 1350 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  44.74 
 
 		 85 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 90 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  37.63 
 
 		 94 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 78 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 78 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 103 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 117 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 83 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  35.63 
 
 		 100 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  43.28 
 
 		 89 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 361 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  41.1 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  41.77 
 
 		 86 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  38.16 
 
 		 78 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  37.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  34.67 
 
 		 108 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 103 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 84 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 83 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  38.71 
 
 		 338 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  38.71 
 
 		 338 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 94 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>