31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2170 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  57.33 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  48.05 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  51.39 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  47.89 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  47.22 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  40.28 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  45.83 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1719  hypothetical protein  64.71 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885175  normal  0.188868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  42.03 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  42.47 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  34.25 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  34.25 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  42.67 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  39.47 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>