81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3428 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  67.9 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  59.74 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  54.12 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  63.75 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  47.56 
 
 		 89 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 359 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  48.65 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  43.37 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  43.59 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  45.95 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  47.22 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  46.15 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  41.25 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  35.53 
 
 		 276 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 267 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  38.67 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  43.84 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  39.74 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  37.84 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1719  hypothetical protein  77.78 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885175  normal  0.188868 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  37.18 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 490 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  37.18 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 1350 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 85 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  37.18 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 87 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>