75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3079 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  176  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  67.9 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  57.69 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  55.81 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  56 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  47.37 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  47.44 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.16 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  49.3 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 359 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  41.89 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  45.33 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  44.74 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  43.24 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  47.22 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  43.84 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  46.25 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  46.38 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  42.47 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  43.84 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3890  hypothetical protein  73.33 
 
 		 33 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.580311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 267 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.18 
 
 		 276 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 490 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  37.66 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 1350 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>