63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7725 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  73.49 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  73.49 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  67.86 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  69.51 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  74.32 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  70.27 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  63.86 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  66.67 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7427  hypothetical protein  64.81 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933357 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  40.85 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  43.24 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  39.74 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  39.47 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  39.47 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  41.56 
 
 		 276 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 		 267 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  37.68 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  42.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 85 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  35.06 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  35.53 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  40.85 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  36.99 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  48.39 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  38.33 
 
 		 338 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  42.17 
 
 		 81 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  36.62 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5078  hypothetical protein  36.14 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>