89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0335 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  49.35 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  47.56 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  47.37 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  46.05 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  51.25 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  48.72 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  45.68 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  41.56 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  42.17 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  40.85 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  44.3 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  40.79 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  39.74 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  46.25 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  42.47 
 
 		 338 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  44.59 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  42.47 
 
 		 338 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  41.1 
 
 		 338 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  46.05 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  40.26 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  44.16 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  39.68 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  37.97 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  37.97 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  43.55 
 
 		 361 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  40.54 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 490 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 359 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  41.89 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1860  PAS sensor protein  45.16 
 
 		 340 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  40.26 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1581  PAS sensor protein  45.16 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  39.24 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  38.1 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 1350 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  37.5 
 
 		 1346 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2489  PAS sensor protein  40.62 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>