47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0207 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 75 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 490 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  44.12 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 1350 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  41.94 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  49.23 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 1352 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  35.48 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  35.48 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  40.85 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  35.71 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  45.95 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  38.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  36.07 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  33.33 
 
 		 1346 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  44.26 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  38.24 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  45.76 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  36.92 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  29.73 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  34.72 
 
 		 78 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>