47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7220 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  76.71 
 
 		 97 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5078  hypothetical protein  67.95 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.16 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  43.24 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  46.75 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  44.16 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 490 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 359 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 1350 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  40.74 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  37.66 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  38.36 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  38.67 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  48.33 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  34.94 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  40.28 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  30.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  40.28 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 87 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>