68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1039 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  183  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  66.27 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  65.38 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  65 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  65.79 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7427  hypothetical protein  71.23 
 
 		 73 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  63.86 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  49.3 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  47.3 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  48.61 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  49.3 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  43.06 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  41.89 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 267 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  34.12 
 
 		 276 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  39.19 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3594  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 361 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419361  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  40.28 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  46.05 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 1350 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  38.1 
 
 		 1346 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  42.03 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  45.21 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  45.16 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>