59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1395 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  76.54 
 
 		 103 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  72.84 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  67.9 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  65 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  76.12 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 77 aa  84.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  67.65 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  39.74 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  41.98 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  40.24 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  40.74 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  35 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  42.5 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  38.1 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  41.25 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  38.27 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1818  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  38.75 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  39.06 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1860  PAS sensor protein  41.67 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1581  PAS sensor protein  41.67 
 
 		 340 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 359 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  37.84 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>