44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2628 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 77 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  72.6 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  72 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  68.49 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  68.49 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  68.49 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  67.12 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  64.38 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  57.53 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  64.62 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  46.48 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  47.95 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  45.21 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  39.73 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 359 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  39.71 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 1350 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  42.62 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  43.24 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>