42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1807 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  82.72 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  82.28 
 
 		 92 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  81.01 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  80 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  76 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  76.25 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  76.39 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  76 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  77.33 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  76 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  63.95 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  80.88 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  72 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  64 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  63.64 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  42.05 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  43.06 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  43.06 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  43.86 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  45.21 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  39.19 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  38.36 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  43.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  37.84 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  40.26 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3775  hypothetical protein  32.91 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 217 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>