48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2974 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  190  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  46.15 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  44.3 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  43.59 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  46.25 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  47.89 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  47.69 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  38.04 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2598  putative PAS/PAC sensor protein  41.43 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  40.79 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  35.56 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  37.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  34.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  34.07 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  35.96 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4357  hypothetical protein  38.27 
 
 		 552 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.742505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>