53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3386 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0641  XRE family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0163  XRE family transcriptional regulator  80 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2611  XRE family transcriptional regulator  83.78 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3883  transcriptional regulator, XRE family  76.62 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105011 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5392  XRE family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0615  XRE family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4118  XRE family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1557  transcriptional regulator, XRE family  78.08 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.684199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5405  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.232793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1807  XRE family transcriptional regulator  76 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2473  helix-turn-helix domain-containing protein  72.73 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1301  XRE family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1107  XRE family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  75 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4805  transcriptional regulator, XRE family  75.36 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2258  XRE family transcriptional regulator  75 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2926  XRE family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2628  XRE family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.759842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4052  XRE family transcriptional regulator  64 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1395  XRE family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0165  helix-turn-helix domain-containing protein  65.15 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  47.95 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  43.84 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  45 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0132  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  44.59 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  41.46 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0256  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  44.87 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  43.24 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  38.96 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  47.37 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 267 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  37.88 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3854  hypothetical protein  38.55 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6642  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.88 
 
 		 270 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0597755  normal  0.174311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>