35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5034 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  59.18 
 
 		 490 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  49.28 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  43.94 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 1350 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5419  hypothetical protein  44.78 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3079  hypothetical protein  41.54 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  39.71 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 1352 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2280  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  36.92 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  39.13 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  35.94 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4147  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2645  hypothetical protein  40.62 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  48 
 
 		 1346 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3920  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3386  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  51.22 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>